É o cloro que se combina com amônia ou outros compostos nitrogenados, produzindo as cloraminas. As cloraminas, apesar de terem propriedades desinfetantes, são bem menos ativas que o cloro residual livre (ver). Nas piscinas o cloro residual combinado é indesejável por que dá odor desagradável à água (o conhecido “cheiro de cloro”) e irrita a pele e os olhos.  As pessoas susceptíveis podem ficar com as vias respiratórias irritadas.